Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIFAP3Q92845 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms