Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6NLQ92738 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6NLQ92738 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6NLQ92738 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP6NLQ92738 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP6NLQ92738 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms