Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms