Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC9Q8TBE3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC9Q8TBE3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms