Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC148Q8NFR7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms