Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms