Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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DTX3Q8N9I9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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DTX3Q8N9I9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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DTX3Q8N9I9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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DTX3Q8N9I9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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DTX3Q8N9I9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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DTX3Q8N9I9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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DTX3Q8N9I9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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