Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN19Q8N6F1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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