Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4DQ86TL0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms