Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC4Q7Z404 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms