Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT27Q7Z3Y8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms