Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3BQ7Z3V4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms