Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC186Q7Z3E2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC186Q7Z3E2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms