Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP1Q7RTM1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP1Q7RTM1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms