Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q71RC1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q71RC1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q71RC1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q71RC1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q71RC1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q71RC1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q71RC1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms