Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP43Q70EL4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP43Q70EL4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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