Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPGS1Q6ZTW0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms