Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBR3Q6ZT12 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms