Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms