Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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