Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms