Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BLOC1S2Q6QNY1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BLOC1S2Q6QNY1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms