Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms