Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms