Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD54Q6NXT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms