Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CARMIL2Q6F5E8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms