Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL1Q5VZK9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms