Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCERG1LQ5VWI1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCERG1LQ5VWI1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms