Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms