Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDLRAD1Q5T700 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms