Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH8Q5T0T0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH8Q5T0T0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms