Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf220Q5T0J3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms