Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms