Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms