Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM47AQ5JRC9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47AQ5JRC9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms