Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf116Q5BN46 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf116Q5BN46 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms