Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms