Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3KQ59H18 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms