Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN3Q4LDR2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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