Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRFIP1Q32MZ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms