Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX7Q2KHR2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX7Q2KHR2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms