Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MICBQ29980 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MICBQ29980 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MICBQ29980 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICBQ29980 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICBQ29980 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICBQ29980 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MICBQ29980 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MICBQ29980 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms