Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms