Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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