Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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FXNQ16595 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FXNQ16595 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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FXNQ16595 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FXNQ16595 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FXNQ16595 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FXNQ16595 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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FXNQ16595 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FXNQ16595 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FXNQ16595 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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FXNQ16595 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FXNQ16595 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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FXNQ16595 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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FXNQ16595 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FXNQ16595 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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