Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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LY6EQ16553 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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LY6EQ16553 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LY6EQ16553 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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