Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCSK7Q16549 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCSK7Q16549 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCSK7Q16549 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCSK7Q16549 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCSK7Q16549 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCSK7Q16549 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCSK7Q16549 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCSK7Q16549 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms