Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
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