Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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