Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CNGA3Q16281 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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CNGA3Q16281 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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